近岸海域水质状况总体保持良好,河口区邻近海域水质一般。全市约2355平方公里海域海水质量符合《海水水质标准》第一类、第二类标准,占91.6%。河口区邻近海域水质一般,汕头港局部海域海水质量较差,主要污染物为无机氮、活性磷酸盐和石油类。近岸海域沉积物质量总体良好,河口附近局部海域沉积物铜、铅含量略超过《海洋沉积物质量》第一类标准,主要海水增养殖区沉积物质量符合第一类标准。
汕头市加大对榕江、练江入海污染物总量的监测力度,结果显示,榕江、练江径流携带入海的CODcr、总氮、总磷、石油类、重金属及砷等污染物总量比2010年分别减少3.5万吨和1.1万吨;但受榕江、练江等河流携带入海的污染物总量影响仍较大,河口区及其邻近海域海洋生态系统依然脆弱。我市海水浴场环境状况良好。其中南澳青澳湾海水盐度和透明度较高,水质状况优,是我市最佳的海水浴场之一。
汕头市通过实施南海伏季休渔制度,实行渔民转产转业政策,落实推进人工鱼礁建设、海洋渔业保护区建设、海洋牧场建设、人工增殖放流等海洋生态修复措施,近海渔业资源快速衰退的势头得到有效遏制,渔业资源量逐年增长,海洋生态环境进一步优化。反映渔业资源状况指标的单拖、围网和刺网平均渔获率分别为76公斤/小时、3368公斤/网、136公斤/小时,比2010年分别增长了26.7%、10.3%和56.1%,均处于近年来最高水平。